Clasificare

(Arborele filogenetic al coronavirușilor. )
Numele științific pentru coronavirus este Orthocoronavirinae sau Coronavirinae. Coronavirusurile aparțin familiei Coronaviridae, din ordinul Nidovirales și refnul Riboviria. Acestea sunt împărțite în alfacoronaviruși și betacoronaviruși care infectează mamiferele – și gamacoronavirusuși și deltacoronaviruși, care infectează în principal păsările.
Origine

(Origini ale coronavirușilor umani cu posibile gazde intermediare.)
Cel mai recent strămoș comun (CMRSC) al tuturor coronavirușilor este estimat că a existat recent până la 8000 î.e.n., deși unele modele plasează strămoșul comun cu 55 de milioane de ani sau mai mult, ceea ce implică o coevoluție pe termen lung cu lilieci și specii aviare. Cel mai recent strămoș comun al liniei alfacoronavirus a fost plasat la aproximativ 2400 î.e.n., al liniei betacoronavirus la 3300 î.e.n., al liniei gamacoronavirus la 2800 î.e.n. și al liniei deltacoronavirus la aproximativ 3000 î.e.n. Liliecii și păsările, ca vertebre zburătoare cu sânge cald, sunt un rezervor natural ideal pentru bazinul genei coronavirus (la lilieci rezervorul pentru alfacoronavirus și betacoronavirus – și la păsări rezervorul pentru gamacoronavirus și deltacoronavirus). Numărul mare și gama globală de specii de lilieci și aviare care găzduiesc viruși au permis evoluția și diseminarea extensivă a coronavirușilor.
Mulți coronaviruși umani își au originea în lilieci. Coronavirusul uman NL63 a împărtășit un strămoș comun cu un coronavirus de lilieci (ARCoV.2) între anii 1190 și 1449. Coronavirusul uman 229E a împărtășit un strămoș comun cu un coronavirus de lilieci (GhanaGrp1 Bt CoV) între anii 1686 și 1800. Mai recent, coronavirusul alpaca și coronavirusul uman 229E s-au separat cândva înainte de 1960. MERS-CoV a apărut la om din lilieci prin intermediul gazdei intermediare de cămile. MERS-CoV, deși înrudit cu mai multe specii de coronavirus de lilieci, pare să se fi separat față de acestea în urmă cu câteva secole. Cel mai strâns legat de coronavirus și SARS-CoV s-a separat în 1986. O posibilă cale de evoluție a coronavirușilor SARS și a coronavirușlor de interes de lilieci este aceea că coronavirușii asociați cu SARS au evoluat mult timp în lilieci. Strămoșii SARS-CoV au infectat prima dată liliecii din genul Hipposideridae; ulterior s-au răspândit la liliecii din specia Rhinolophidae, apoi la civetele palmiere asiatice și, în final, la oameni.
Spre deosebire de alte betacoronaviruși, se consideră că coronavirusul bovin din speciile Betacoronavirus 1 și subgenul Embecovirus își au originea în rozătoare și nu în lilieci. În anii 1790, coronavirusul ecvin s-a separat de la coronavirusul bovin după un salt al speciilor încrucișate. Mai târziu în anii 1890, coronavirusul uman OC43 s-a abătut de la coronavirusul bovin după un alt eveniment de răspândire a speciilor încrucișate. Se speculează că pandemia de gripă din 1890 ar fi putut fi cauzată de acest eveniment de răspândire, și nu de virusul gripal, din cauza momentului aferent, a simptomelor neurologice și a agentului cauzal necunoscut al pandemiei. Pe lângă faptul că provoacă infecții respiratorii, coronavirusul uman OC43 este, de asemenea, suspectat de a juca un rol în bolile neurologice. În anii 1950, coronavirusul uman OC43 a început să se schimbe în genotipurile sale actuale. Filogenetic, virusul hepatitei de șoarece (coronavirus Murine), care infectează ficatul și sistemul nervos central al șoarecelui, este legat de coronavirusul uman OC43 și coronavirusul bovin. Coronavirusul uman HKU1, la fel ca virușii menționați, își are originile și în rozătoare.
Infecția la om

(Ilustrația virionului SARSr-CoV. )
Coronavirușii variază semnificativ în ceea ce privește factorul de risc. Unii pot ucide mai mult de 30% dintre cei infectați, cum ar fi MERS-CoV, iar unii sunt relativ inofensivi, cum ar fi gripa comună. Coronavirușii pot provoca răceli cu simptome majore, cum ar fi febra și o durere în gât din adenoidele umflate. Coronavirușii pot provoca pneumonii (fie pneumonie virală directă fie pneumonie bacteriană secundară) și bronșită (fie bronșită virală directă fie bronșită bacteriană secundară). Coronavirusul uman descoperit în 2003, SARS-CoV, care determină sindromul respirator acut sever (SARS), are o patogeneză unică, deoarece cauzează infecții ale tractului respirator superior și inferior.
Se cunosc șase specii de coronaviruși umani, o singură specie fiind împărțită în două tulpini diferite, făcând șapte tulpini de coronavirus uman.
Patru coronaviruși umani produc simptome care sunt în general ușoare:
- Coronavirus uman OC43 (HCoV-OC43), β-CoV
- Coronavirus uman HKU1 (HCoV-HKU1), β-CoV
- Coronavirus uman 229E (HCoV-229E), α-CoV
- Coronavirus uman NL63 (HCoV-NL63), α-CoV
Trei coronaviruși umani produc simptome potențial severe:
- Coronavirusul legat de sindromul respirator din Orientul Mijlociu (MERS-CoV), β-CoV
- Coronavirusul sindrom respirator acut sever (SARS-CoV), β-CoV
- Coronavirusul sindrom respirator acut sever 2 (SARS-CoV-2), β-CoV
Gripa
Coronavirusușii HCoV-OC43, HCoV-HKU1, HCoV-229E și HCoV-NL63 circulă continuu în populația umană și produc simptomele în general ușoare ale gripei obișnuite la adulți și copii din întreaga lume. Acești coronaviruși provoacă aproximativ 15% din răcelile obișnuite, n timp ce 40 până la 50% din răceli sunt cauzate de rinovirusuri. Cei patru coronaviruși ușori au o incidență sezonieră care apare în lunile de iarnă în climat temperat. Nu există preponderență în niciun sezon în climatul tropical.
Sindrom respirator acut sever (SARS)
În 2003, în urma izbucnirii sindromului respirator acut sever (SARS), care a început anul precedent în Asia și a unor cazuri secundare în altă parte a lumii, Organizația Mondială a Sănătății (OMS) a emis un comunicat de presă în care a declarat că un nou coronavirus identificat de un număr de laboratoare a fost agentul cauzal pentru SARS. Virusul a fost denumit oficial coronavirus SARS (SARS-CoV). Peste 8.000 de persoane au fost infectate, aproximativ zece la sută dintre ele au murit.
Sindromul respirator din Orientul Mijlociu (MERS)
În septembrie 2012, a fost identificat un nou tip de coronavirus, numit inițial Novel Coronavirus 2012, iar acum oficial numit coronavirusul sindromul respirator Orientul Mijlociu (MERS-CoV). Organizația Mondială a Sănătății a emis o alertă globală la scurt timp. Actualizarea OMS din 28 septembrie 2012 a spus că virusul nu părea să treacă cu ușurință de la o persoană la alta. Cu toate acestea, la 12 mai 2013, Ministerul Afacerilor Sociale și Sănătății a confirmat un caz de transmitere de la om în Franța. În plus, au fost raportate cazuri de transmitere de la om la om de către Ministerul Sănătății din Tunisia. Două cazuri confirmate au implicat persoane care păreau că au prins boala de la tatăl lor, care s-a îmbolnăvit după o vizită în Qatar și Arabia Saudită. În ciuda acestui fapt, se pare că virusul a avut probleme să se răspândească de la om la om, întrucât majoritatea persoanelor infectate nu transmit virusul. Până la 30 octombrie 2013, în Arabia Saudită au existat 124 de cazuri și 52 de decese.
După ce Erasmus Medical Center din Olanda a secvenșiat virusul,, virusul a primit un nou nume, Human Coronavirus — Erasmus Medical Center (HCoV-EMC). Numele final al virusului este coronavirusul sindromul respirator din Orientul Mijlociu (MERS-CoV). Singurele două cazuri din SUA (ambele au supraviețuit) au fost înregistrate în mai 2014.
În mai 2015, un focar de MERS-CoV a avut loc în Republica Coreea, când un bărbat care a călătorit în Orientul Mijlociu, a vizitat patru spitale din zona Seul pentru a-i trata boala. Aceasta a provocat una dintre cele mai mari focare de MERS-CoV în afara Orientului Mijlociu. În decembrie 2019, 2.468 de cazuri de infecție MERS-CoV au fost confirmate prin teste de laborator, dintre care 851 au fost fatale, o rată a mortalității de aproximativ 34,5%.
Boala Coronavirus 2019 (COVID-19)
În decembrie 2019, a fost raportat un focar de pneumonie la Wuhan, China.La 31 decembrie 2019, focarul a fost urmărit într-o nouă tulpină de coronavirus, care a primit numele interimar 2019-nCoV de Organizația Mondială a Sănătății (OMS), mai apoi redenumită SARS- CoV-2 de către Comitetul internațional pentru taxonomia virușilor.
Începând cu 6 august 2020, au existat cel puțin 706.342 decese confirmate și peste 18.752.917 cazuri confirmate în pandemia COVID-19. Tulpina Wuhan a fost identificată ca o nouă tulpină de Betacoronavirus din grupul 2B cu aproximativ 70% asemănare genetică cu SARS-CoV.Virusul are o similitudine de 96% cu coronavirusul liliacului, astfel încât se suspectează pe scară largă că provine de la lilieci. Pandemia a avut ca rezultat restricții de călătorie și blocaje la nivel național în multe țări.
Lasă un răspuns